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유전체 데이터 다루기 (2):: SRAtoolkit 사용법
SRA는 대규모의 유전체 시퀀싱 데이터를 저장하는 공개 데이터베이스로, 여기에는 다양한 생물종의 DNA와 RNA 시퀀싱 데이터가 포함되어 있습니다. sratoolkit은 특히 FASTQ 형식의 원시 시퀀싱 데이터를 다운로드하는데 유용합니다. 아래에서 FASTQ 데이터 다운로드를 위해 사용되는 sratoolkit을 설치하고 사용하는 방법에 대해 알려드리려 합니다. sratoolkit 파일 설치먼저 sratoolkit을 로컬 컴퓨터 환경에 맞게 설치합니다. 필자는 Mac OS 환경에서 작업했습니다. 아래 코드는 url을 사용해서 설치하는 코드입니다. https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/02.-Installing-SRA-Toolkit 02. Installing SRA Too..
유전체데이터 분석/분석실습
2024. 7. 5. 10:37