쏘의 해피월드

유전체 데이터를 다루려면 원시데이터인 FASTQ 파일을 전처리를 해야합니다.예를 들어, DNA의 경우 VCF 파일로, RNA-seq 또는 scRNA-seq의 경우 counts table로 만들어야 합니다. Nextflow는 유전체 데이터 전처리를 위한 자동화 파이프라인입니다.전처리 단계별 도구들을 불러와 한 번에 구동할 수 있는 편리한 도구입니다. Nextflow 설치Nextflow를 설치합니다. 공식 버전, Quick-start 설치, Bioconda를 활용한 설치가 있습니다. 다음 튜토리얼에서는 Anaconda 환경을 설정하여 독립적인 환경에서 Nextflow를 설치하는 방법을 기술했습니다. (아래 스텝은 MacOS 환경의 작업입니다.) 아나콘다 환경 설정먼저, 아래 두 체널을 세팅함으로써 Bioco..