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유전체데이터 분석/분석실습

[MSigDB] GO 관련 Gene set 찾기

쏘이언티스트 2023. 4. 19. 13:43

https://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/

 

23.04.20 업데이트

R에서 msigdbr 라이브러리가 있어서 R 상에서 데이터베이스를 다운받아 사용가능하다!

install.packages("msigdbr")

library(msigdbr)

hallmark_gene_sets <- msigdbr(species = 'Homo sapiens', category = 'H') 

# category "H" is only hall mark gene sets

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