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유전체데이터 분석/기본개념

유전자 발현 분석이란? (Gene expression profiling)

쏘이언티스트 2021. 9. 23. 10:37
유전자 발현분석 (Gene expression profiling)

한 번에 수천 개의 유전자 활성을 측정하는 것.

 

유전자 발현 분석은 '정상적인 생물학적 프로세스'와 '질병 프로세스'에서의 유전자 발현 차이, 바이오마커 시그니처(biomarker signature) 식별과 검증에 인사이트를 제공하기 위함이다.

 

아래 그림과 같이 특정 환경변화에 따른 여러 유전자(프로파일링) 또는 여러 샘플(스크리닝)의 발현 정도동시에 비교하는 것이다.

 

이 분석은 (1)유전자의 표현형 차이를 확인하고 (2)유전자 발현 타겟을 선별하는데 도움이 된다. 이러한 유전자 발현 차이는 특정 질병 표현형의 잠재적인 바이오마커 발견으로 이어질 수 있으며, 더 나아가 바이오마커 검증을 가능하게 한다.

 

예를들어, DNA microarrays는 이전에 식별된 표적 유전자에 상대적인 활성을 측정한다. RNA-seq과 같은 서열(sequence) 기반 기술들은 유전자 서열에 대한 정보뿐만 아니라 발현수준(expression level)을 제공한다.

 

DNA microarrays와 RNA-seq에 대한 내용은 다음 포스팅에!

 

Gene expression profiling

 

참고사이트

 

Gene expression profiling - Wikipedia

Heat maps of gene expression values show how experimental conditions influenced production (expression) of mRNA for a set of genes. Green indicates reduced expression. Cluster analysis has placed a group of down regulated genes in the upper left corner. In

en.wikipedia.org

https://en.wikipedia.org/wiki/Gene_expression_profiling

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